Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms