Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RdxP26043 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RdxP26043 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RdxP26043 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RdxP26043 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RdxP26043 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RdxP26043 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RdxP26043 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RdxP26043 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RdxP26043 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RdxP26043 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RdxP26043 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RdxP26043 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RdxP26043 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RdxP26043 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RdxP26043 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RdxP26043 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RdxP26043 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms