Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms