Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6bP23440 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms