Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RarbP22605 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RarbP22605 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RarbP22605 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RarbP22605 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RarbP22605 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RarbP22605 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RarbP22605 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms