Protein–RNA interactions for Protein: P20863

Gdf1, Embryonic growth/differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf1P20863 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdf1P20863 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdf1P20863 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms