Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxb9P20615 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb9P20615 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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