Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms