Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou5f1P20263 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou5f1P20263 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms