Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P20040 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P20040 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P20040 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P20040 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
P20040 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
P20040 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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