Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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