Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NefhP19246 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NefhP19246 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NefhP19246 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NefhP19246 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NefhP19246 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms