Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka1P18653 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms