Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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