Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxb1P17919 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxb1P17919 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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