Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnmt1P13864 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnmt1P13864 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms