Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DmdP11531 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DmdP11531 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DmdP11531 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms