Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RaraP11416 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RaraP11416 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RaraP11416 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RaraP11416 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RaraP11416 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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