Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prf1P10820 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms