Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P10404 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P10404 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms