Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Schip1P0DPB4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms