Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tmem254bP0DN90 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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