Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms