Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spta1P08032 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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