Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XlrP05531 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XlrP05531 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XlrP05531 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XlrP05531 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XlrP05531 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XlrP05531 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XlrP05531 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XlrP05531 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XlrP05531 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XlrP05531 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms