Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01738 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01738 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01738 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01738 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01738 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01738 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01738 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01738 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01738 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01738 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01738 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01738 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01738 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01738 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01738 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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