Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01645 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01645 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01645 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01645 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01645 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01645 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01645 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01645 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01645 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01645 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01645 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01645 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01645 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01645 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01645 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01645 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms