Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01644 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01644 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01644 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01644 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01644 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01644 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms