Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopeO89079 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopeO89079 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopeO89079 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopeO89079 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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CopeO89079 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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CopeO89079 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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CopeO89079 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopeO89079 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CopeO89079 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CopeO89079 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopeO89079 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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CopeO89079 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CopeO89079 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CopeO89079 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CopeO89079 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CopeO89079 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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