Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms