Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccl22O88430 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccl22O88430 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl22O88430 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms