Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Xirp1O70373 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms