Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb5O70309 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb5O70309 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms