Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgceO70258 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgceO70258 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SgceO70258 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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