Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pja1O55176 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms