Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChkaO54804 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChkaO54804 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChkaO54804 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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