Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffaO54786 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffaO54786 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffaO54786 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms