Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cavin1O54724 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms