Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek2O35942 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Nek2O35942 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nek2O35942 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Nek2O35942 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nek2O35942 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nek2O35942 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nek2O35942 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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