Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pik3cdO35904 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pik3cdO35904 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms