Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Clk2O35491 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clk2O35491 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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