Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn6O35454 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clcn6O35454 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms