Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxd2O35392 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxd2O35392 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms