Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh2d1bO35324 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh2d1bO35324 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms