Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms