Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap23O09044 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snap23O09044 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snap23O09044 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms