Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Degs1O09005 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Degs1O09005 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Degs1O09005 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Degs1O09005 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Degs1O09005 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Degs1O09005 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Degs1O09005 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Degs1O09005 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Degs1O09005 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Degs1O09005 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Degs1O09005 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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