Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps1O08983 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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