Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PbsnO08976 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PbsnO08976 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PbsnO08976 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PbsnO08976 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PbsnO08976 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PbsnO08976 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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PbsnO08976 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PbsnO08976 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms