Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx2O08686 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms